Shamakhi

El equipo fue fundado en 1997 como «Khazar Universiteti» por estar vinculado a la Universidad Khazar. Después de dos años en categorías amateur, debutaría en la Liga Premier de Azerbaiyán a partir de la temporada 1999/2000 y desde entonces luchó por la permanencia.​ Gracias a un cuarto puesto en la edición 2003/04, obtuvo su primera clasificación para la Copa Intertoto 2004.​

En el verano de 2004, todos los activos del club universitario fueron transferidos a un nuevo equipo con estructura profesional, llamado «Inter Baku», que estaba patrocinado por el Banco Internacional de Azerbaiyán. Gracias a nuevas contrataciones y una importante inversión, la entidad fue finalista en la Copa de Azerbaiyán en 2005 y obtuvo dos títulos de Liga en 2007/08 y 2009/10, para convertirse después en una de las potencias del fútbol nacional. Su mejor actuación europea tuvo lugar en la Liga de Campeones de 2008, pues alcanzaron la segunda ronda clasificatoria.​ Y en 2011 se proclamaron vencedores de la última Copa de Clubes de la CEI tras derrotar en la final al Shakhtyor Soligorsk bielorruso.

En 2016 el Inter se declaró en bancarrota porque el Banco Internacional dejó de poner dinero, y la UEFA decretó una sanción de tres años sin competiciones europeas. A partir del 28 de octubre de 2017, el equipo pasó a llamarse «Keshla FK». El 6 de abril de 2022 la Liga Premier de Azerbaiyán aprobó el cambio de nombre a Shamakhi FK.​