Cuenca Juniors

Cuenca Juniors fue fundado con el propósito de promover el talento local y ofrecer oportunidades de desarrollo deportivo a jóvenes futbolistas de la región austral del Ecuador. Desde sus inicios, el club se ha caracterizado por su enfoque en las divisiones formativas y su marcada identidad cuencana.

La familia Eljuri ha desempeñado un papel fundamental en el rápido crecimiento y consolidación de la institución como un nuevo protagonista del fútbol ecuatoriano. Miembros de esta familia, entre ellos Juan Pablo Eljuri y Juan Gustavo Palacios, han estado directamente involucrados en las decisiones deportivas y financieras del club, bajo el lema: «Cuenca Juniors representa fútbol, pasión y orgullo cuencano. Jugamos con corazón, vivimos para ganar. Vinimos a hacer historia».​

La sede administrativa del club fue registrada en la parroquia Yanuncay y la personería jurídica fue finalmente aprobada por el Ministerio del Deporte el 26 de octubre de 2023.​

El equipo inició su participación oficial en el Campeonato de Segunda Categoría de Azuay 2024,​ temporada en la que bajo la dirección técnica de Juan Ramón Silva tuvo un desempeño sobresaliente al conquistar el título provincial de manera invicta. Sus estadísticas fueron notables: 10 victorias y 2 empates, con 53 goles a favor y solo 3 en contra.​ En la final se impuso por penales al Aviced Fútbol Club, obteniendo así su primera estrella.​ Gracias a este logro clasificó a la fase nacional por el ascenso a la Serie B del fútbol ecuatoriano, donde avanzó hasta los cuartos de final. En esa instancia fue eliminado por La Unión de Pujilí, después de haber superado a clubes como Deportivo Meridiano, Guaranda Fútbol Club y La Troncal Fútbol Club.​

En la temporada 2025, el club volvió a tener una destacada participación, obteniendo el bicampeonato provincial con un registro de 13 victorias y una sola derrota.​ En la final derrotó nuevamente al Aviced Fútbol Club, esta vez por 3-1 en los 90 minutos reglamentarios.​​ Posteriormente, continuó su participación en la fase nacional por el ascenso a la Serie B.​

Como campeón provincial, Cuenca Juniors disputó también la Copa Ecuador 2025, logrando otra actuación destacada en torneos organizados por la Federación Ecuatoriana de Fútbol. En la fase previa eliminó al club de Serie B Atlético Vinotinto en penales 5-4 tras empatar 2-2. En los dieciseisavos de final protagonizó una de las mayores sorpresas del certamen al vencer 2-0 a Barcelona Sporting Club en el Estadio Alejandro Serrano Aguilar, con goles de Roberto «La Tuka» Ordóñez y el nigeriano Feyiseitan Asagidigbi.​​​ El resultado tuvo amplia repercusión a nivel nacional.​​ En octavos de final goleó 6-1 a La Cantera de Pastaza​ y en cuartos de final enfrentó al 9 de Octubre.