Kilmarnock

Stewarton Thistle

El historiador local Alastair Barclay escribió en 1973 que un equipo de fútbol femenino fue fundado en Stewarton 12 años antes "más o menos para reír", pero que rápidamente había eclipsado los logros modestos de los equipos masculinos de la ciudad.​

Sue Lopez registró en su libro Women on the Ball (1997) que el club se formó en 1961 a pedido del Lord Provost, para recaudar dinero para la campaña Freedom from Hunger. El club disfrutó del éxito local y, con la jugadora estrella Rose Reilly, llegó a la final de la primera Copa FA Femenina en 1971. Jugó bajo los auspicios de la Asociación Inglesa de Fútbol Femenino, la competencia admitió a los equipos escoceses y galeses en sus primeros años. Stewarton Thistle perdió 4–1 ante el Southampton de López en el Crystal Palace National Sports Center.​

En 1972 llegaron a la final nuevamente, jugando bajo el nombre de Lee's Ladies debido a un acuerdo de patrocinio de derechos de nombre. Southampton los derrotó nuevamente, 3–2 en Eton Park en Burton upon Trent.​

Kilmarnock

En 1999 el club se hizo conocido como Kilmarnock.​ La primera parte de la década de 2000 vio al mánager Jim Chapman reunir un equipo fuerte con varias jugadoras del equipo nacional de fútbol femenino de Escocia.​ El club ganó el campeonato de la liga dos veces​ y fue el representante de Escocia en la Copa Femenina de la UEFA en 2002-03 y 2003-04.

Más adelante en la década, Kilmarnock tuvo mucho menos éxito, con un equipo joven e inexperto que a menudo sufría grandes derrotas. En mayo de 2010 se produjo una pérdida de 29-0 en el campeón de Glasgow City.​ En 2011 terminaron en último lugar en la Premier League femenina de Escocia, pero se salvaron del descenso debido a la escasez de equipos.​ La única victoria del equipo de la temporada, 2-0 contra Falkirk, se cambió a una derrota por 3-0 cuando surgió que una de las jugadoras de Kilmarnock estaba a seis semanas de cumplir 15 años y no era elegible para el fútbol senior.​

Sin embargo, en la temporada 2012, volvieron a tocar fondo y fueron relegados.

En la temporada SWPL 2018, el recién ascendido Kilmarnock perdió su primer partido de liga de la temporada en casa contra Motherwell 2-1. Después del partido, Kilmarnock se quejó de que Motherwell no había seguido los procedimientos SWF correctos. Kilmarnock posteriormente fue recompensado con una victoria por 3-0 sobre Motherwell. El resultado los colocó en la parte superior del SWPL2.​