Mushuc Runa SC

El club nació el 2 de enero del 2003. Etimológicamente, su nombre viene del quichua: Mushuc que significa nuevo, y Runa que significa hombre, persona o ser humano, por lo que su traducción literal es "Hombre Nuevo". Este equipo fue fundado y adopta su nombre a raíz de una cooperativa de ahorro comunitaria formada por indígenas Chibuleos de la provincia de Tungurahua.

Sus colores tradicionales son el blanco, verde y rojo.

Ascenso a la Serie B

Tras conseguir su segundo título en el Campeonato Provincial de Segunda Categoría de Tungurahua participaría en el Segunda Categoría de Ecuador 2011 en el cual jugaría en el Grupo A de la Zona 1, y cuyos rivales fueron los cuadros de Cuniburo F.C., Star Club, Dep. Cotopaxi y Unibolívar, logrando clasificar a la siguiente fase y ganando su grupo de manera invicta, ya que de los 6 encuentros jugados; obtendría el triunfo en 5 ocasiones, siendo su mejor resultado ante el Star Club a quien golearía de visita por 7-0, y solo empataría de local ante Cuniburo F.C. a un gol por bando. Ya en la 2.ª fase, participaría en el Grupo A y los rivales serían los cuadros de Águilas, Alianza del Pailón, Club Social y Deportivo Macas, Fuerza Amarilla y Cuniburo F.C.. Nuevamente se ubicaría en el primer lugar con 22 puntos tras ganar 7 juegos y empatar y perder en una sola ocasión. La clasificación se la daría en la última fecha en la goleada de visita por 7-1 ante el cuadro de Fuerza Amarilla; ya asegurado el boleto al Campeonato Ecuatoriano de Fútbol Serie B 2012 definiría el torneo ante el cuadro del Ferroviarios. En el primer encuentro jugado en la ciudad de Durán el cuadro de Mushuc Runa ganaría por 2-1, pero el título se le escaparía de las manos en el encuentro de vuelta ya que perdería por un marcador de 3-2, siendo el marcador global de 4-4 pero el gol de visita favorecería al Ferroviarios, haciendo que el Mushuc Runa obtenga el subcampeonato.

Un nuevo descenso

En el año 2016, luego una magra campaña, incluyendo cambio de técnico, llegaba la penúltima fecha, en la cual necesitaba con urgencia un triunfo para salir del fondo de la tabla, sólo obtuvo una derrota con Barcelona a 4-2, con esto Mushuc Runa quedó virtualmente descendido a la Serie B, ratificándose en la última fecha al ganar por 1-2 de visitante frente a Liga de Quito, así finalmente se consumó el retorno del cuadro Cooperativista a la Serie B del fútbol ecuatoriano.

Un nuevo ascenso y un repechaje de la Copa Sudamericana 2019

Para la campaña de 2018 en la Serie B el cuadro del Mushuc Runa haría una gran campaña en la que lo convertiría en el campeón tras ganar en la última fecha al conjunto de Puerto Quito por marcador de 2-0 al finalizar el torneo acumularía un total de 80 puntos disputaría el repechaje a la Copa Sudamericana 2019 contra el Aucas equipo que terminaría en el 8.º puesto de la tabla acumulada de la Serie A 2018, en los juegos el cuadro del Mushuc Runa se lo vio como un equipo sólido y al final ganaría la serie por marcador global de 3-2 (1-0 en la ida y 2-2 en la vuelta) dándole su primera clasificación a un torneo internacional.

En el primer partido de Copa Sudamericana empató 1-1 con el equipo Unión Española con gol de Esteban Rivas para los visitantes y David Llanos para los chilenos. En el partido de vuelta en el Estadio Bellavista de Ambato igualó 1-1 con gol de Alejandro Rébola para el ponchito y José Aja para los visitantes pero en la tanda de penales perdió por 6 a 5 quedando eliminado.

Histórica participación en la Copa Sudamericana 2025

Mushuc Runa en la temporada 2024 del Serie A de Ecuador, finalizó en 6º posición, lo que le otorgó el derecho a jugar la Copa Sudamericana 2025 en su primera fase (fase nacional). En dicha fase enfrentó a Orense a partido único siendo favorecido en el sorteo de la localía, que la ejerció en el Estadio Olímpico Fernando Guerrero de Riobamba, y no en Ambato, donde es originario, por diferencias políticas entre el presidente vitalicio del club, Luis Alfonso Chango con la administración municipal de Diana Caiza.​ El partido jugado del 5 de marzo de 2025 lo ganó 2-1 clasificándose a la fase de grupos.​​

En el sorteo de fase de grupos, fue ubicado en el Grupo E junto a Cruzeiro de Brasil, Palestino de Chile y Unión de Santa Fé de Argentina.​​ Desde el primer momento, hinchas de aquellos equipos y la prensa internacional reaccionaron con sorpresa, tanto por la poca tradición y experiencia internacional como por el nombre y origen del club.​