YSCC

El equipo fue fundado en 1986 por un grupo de futbolistas procedentes del All Nippon Airways, recientemente ascendido a la máxima categoría nacional, y que habían sido expulsados tras enfrentarse a la directiva.​ La nueva entidad se llamó «Yokohama Sports Club» y en sus orígenes era un club de fútbol base ligado a la formación de jugadores en el barrio de Naka, mientras el ANA —más tarde renombrado Yokohama Flügels— se convirtió en un equipo profesional. En 1987 pasó a llamarse «Yokohama Soccer & Culture Club».

Las actuaciones del YSCC se limitaron durante dos décadas a la liga prefectural de Kanagawa. En 1999, cuando Yokohama Flügels fue absorbido por su rival local del Yokohama Marinos, el YSCC apoyó la creación del Yokohama FC por parte de los socios disconformes con la fusión, pero mantuvo su estructura independiente.

En 2002, la junta directiva transformó a la entidad en una organización sin ánimo de lucro que pasó a llamarse «Yokohama Sports & Culture Club». Con el paso del tiempo fue ascendiendo categorías hasta llegar a la división regional de Kantō, de la cual fue campeón tres años consecutivos, desde 2009 hasta 2011. Finalmente logró subir la Japan Football League (JFL) en la liga de ascenso, y debutó en la temporada 2012 con un sexto lugar.

El YSCC fue uno de los fundadores de la tercera división profesional —J3 League— en 2014. Se mantuvo en dicha categoría durante once temporadas en las que mantuvo una estructura modesta y próxima a la comunidad, al tiempo que hizo mejoras para mantener la licencia profesional. En la edición 2024 quedó penúltimo y descendió a la JFL tras haber perdido la eliminatoria de permanencia contra el Kochi United. Desde entonces permanece en la cuarta categoría.