Khimki

Débuts dans les échelons inférieurs (1996-2001)

Le club est créé au cours de l'année 1996 sur la base du Novator et du Rodina, deux équipes amateurs de la ville qui s'unissent pour former un club unique. Intégré au groupe Podmoskovié de la cinquième division, l'équipe nouvellement fondée joue son premier match officiel le 17 mai 1996 face à Podolsk, remporté 3-1 et auquel assistent près de 3 000 personnes. Le premier entraîneur de Khimki est Vladimir Chtapov, ancien joueur du Dynamo Moscou qui entraînait alors le Novator depuis plusieurs années. Sous sa direction, le club termine premier de son groupe, ne subissant qu'un seul revers en vingt-deux matchs, et accède à la quatrième division ainsi qu'au statut professionnel.

Dans la foulée de sa promotion, Khimki est formellement fondé le 30 janvier 1997, qui devient ainsi la date anniversaire du club. Pour sa première saison professionnelle, l'équipe est intégrée au troisième groupe de la quatrième division, dont il parvient à atteindre la deuxième place derrière la réserve du Dynamo Moscou et a enchaîner une deuxième promotion d'affilée en étant promu en troisième division. Malgré ce succès, le contrat de Chtapov n'est pas renouvelé et il quitte le club à la fin de la saison.

Sous la direction d'Igor Bychkov puis de Ravil Sabitov, Khimki conclut sa première saison au troisième échelon sur une dixième place dans le groupe Ouest. Transféré dans le groupe Centre en 1999, les performances de l'équipe s'améliorent avec une sixième place tandis que les dirigeants établissent comme objectif une promotion en deuxième division pour la saison suivante. Sous la houlette d'Aleksandr Piskariov, le club connaît un mauvais départ qui amène à son renvoi au mois de mai au profit de son adjoint Viktor Papaïev. Avec son arrivée, les performances de l'équipe s'améliorent fortement et il parvient à l'amener à la première place du groupe à l'issue de la saison et à se qualifier pour les barrages de promotion. Ceux-ci se concluent cependant sur une défaite face au Severstal Tcherepovets aux buts à l'extérieur et au renvoi de Papaïev. Cependant durant l'intersaison, le Severstal annonce ne pas pouvoir prendre part à la compétition pour des raisons financières, amenant à la promotion administrative de Khimki, qui découvre ainsi le deuxième échelon cinq ans après sa création lors la saison 2001.

Stabilisation et montée en première division (2001-2006)

Les premières années du club en deuxième division sont marqués par des résultats irréguliers qui l'amène à des places de milieu de tableau entre 2001 et 2003 ainsi qu'à de multiples changements d'entraîneurs en cours de saison. L'année 2004 voit l'arrivée d'un nouveau président en la personne de Vladimir Streltchenko, qui décide de réorganiser l'organigramme du club avec notamment la nomination de Pavel Yakovenko au poste d'entraîneur et le recrutement de joueurs prometteurs ou d'expériences tels que Georgi Lomaia, Pavel Pogrebniak, Vitali Grichine, Aleksandr Danichevski ainsi qu'Andreï Tikhonov, ancien joueur du Spartak Moscou et du Krylia Sovetov Samara dont l'arrivée en décembre 2004 fait sensation.

Se plaçant comme un prétendant de premier ordre à la promotion pour la saison 2005, l'équipe effectue également un parcours remarquable en Coupe de Russie, où il élimine plusieurs clubs de première division tels que l'Alania Vladikavaz, le Torpedo Moscou et l'Amkar Perm pour atteindre la finale de la compétition pour la première fois de son histoire. Les Khimkiens sont finalement vaincus à ce stade par le CSKA Moscou sur le score d'un but à zéro. Les performances en championnat ne sont cependant pas aussi luisants, où l'équipe termine la saison à la quatrième place à quatre points des places de promotion. À la suite de cette déception, une grande partie de l'équipe et de l'encadrement technique quittent le club à l'issue de la saison.

Pour compenser ces départs, la direction nomme comme entraîneur Vladimir Kazatchionok et s'atèle une nouvelle fois à reconstruire l'équipe en engageant notamment les vétérans Roman Berezovsky, Iouri Drozdov, Vladimir Bestchastnykh qui forment avec Tikhonov le cœur de l'équipe à l'aube de la saison 2006. Cette campagne s'avère réussite, Khimki s'installant rapidement dans les places de promotion avant de terminer champion de deuxième division devant le Kouban Krasnodar avec un total de 99 points en quarante-deux matchs. Le club découvre ainsi la première division en 2007, onze ans après sa création.

Premier passage dans l'élite (2007-2009)

La montée dans l'élite s'accompagne d'un remaniement de l'effectif, avec notamment de nombreux recrutements à l'étranger avec les arrivées du Slovène Nastja Čeh, des Bosniaques Dragan Blatnjak et Vule Trivunović, de l'Estonien Andrei Stepanov ainsi que des locaux Roman Chirokov et Roman Vorobiov. Pour sa première campagne au premier échelon, le club termine à une confortable neuvième place au classement, principalement porté par ses bons résultats à domicile avec notamment une victoire 3-0 contre le Spartak Moscou et seulement deux défaites concédées à la maison tout au long de la saison.

La saison suivante s'avère cependant plus compliquée pour le club, qui ne parvient à compenser les départs de ses principaux joueurs, notamment Tikhonov, Čeh et Stepanov, dont les performances des remplaçants, entre autres Egor Titov, Renat Sabitov, Florin Șoavă ou Fiodor Koudriachov peinent à convaincre. Khimki termine ainsi la saison 2008 en tant que premier non-relégable à la quatorzième place. Dans la foulée, les autorités de l'oblast de Moscou font part d'un plan de fusion du club avec le Saturn Ramenskoïe pour répondre aux difficultés issues de la crise économique. Ce plan est cependant abandonné rapidement et le club se voit allouer un nouveau budget de 300 millions de roubles pour la saison 2009.