San Marcos

Fondé en 1964 par des étudiants de l'université de San Agustín à Arequipa, son plus haut fait d'armes reste sa victoire 4-2 en finale de la Copa Perú 2002 face à l'Atlético Grau. Cela lui permet de disputer le championnat de 1re division l'année suivante. Il s'y maintient tant bien que mal jusqu'à la saison 2005 où il est relégué. Ses dirigeants décident alors de vendre leur place en 2e division au CD Alfonso Ugarte de la ville de Puno. Le club disparaît par la suite et son président Rolando Cornejo Cuervo est condamné en 2019 à cinq ans de prison ferme pour avoir détourné des fonds de l'université de San Agustín – dont il était le recteur – afin de payer des joueurs de l'équipe entre 2003 et 2005.

À noter qu'un autre club du nom de Atlético Universidad Arequipa joue en Copa Perú depuis 2012. Même si ce dernier se réclame de l'Atlético Universidad originel, il s'agit formellement de deux clubs différents.