Rayo Vallecano II

W latach 80. i 90. klub był znany jako zespół jo-jo, z powodu swoich częstych spadków do Segunda División i powrotów do Primera División, w sezonie 1998/1999 awansował ponownie do La Liga i spędził w niej kilka sezonów, w tym najbardziej udany sezon 2000/2001, kiedy to zespół dotarł do ćwierćfinału Pucharu UEFA, ulegając późniejszym finalistom tych rozgrywek Deportivo Alavés. Później klub dopadł kryzys, w sezonie 2002/2003 spadł do Segunda División, zaś rok później do Segunda División B. Od 2008 roku klub ponownie jednak grał w Segunda División. W roku 2011 klub wywalczył awans do najwyższej klasy rozgrywkowej Primera División, w której utrzymał się do końca sezonu 2015/16, spadając do drugiej klasy rozgrywkowej.

Spotkanie Rayo Vallecano – Albacete, które miało miejsce 10 czerwca 2020 roku, było pierwszym w Hiszpanii oficjalnym meczem piłkarskim po przerwie spowodowanej pandemią COVID-19. Rozegrano wtedy drugą połowę meczu rozpoczętego 15 grudnia 2019 roku, który został przerwany po pierwszej połowie z powodu obraźliwych wyzwisk skierowanych w zawodnika Rayo, Romana Zozulę.

Znany hiszpański zespół muzyki ska Ska-P napisał o tym klubie dwie piosenki (Como un rayo i Rayo Vallecano).